Q.データパックのインストールでこれまでのエディットは上書きされる？

　A.エディットの項目や、適用するデータパックにより内容が異なります。
　それぞれの条件については、公式FAQに以下のように記載されています。

質問
新しいデータパックを適用すると、それまでエディットした内容はもとに戻ってしまいますか

答え[2015/10/30 更新]
データパックの影響はエディット内の項目ごとに挙動が異なります。
また、「DP1.0」と「DP2.0以降」のデータパック適用で挙動が異なりますので、下記をご参考ください。

＜DP1.0適用時＞
■データパックを適用する際にアップデート「する」か「しない」かを選択できます
・代表選出
・移籍

■データパックを適用するとエディット内容が取り消され初期状態に戻ります
・出場チーム編成
・選手

■エディットしていない項目にのみアップデートが適用され、エディットした項目は保持されます
・チーム
・スタジアム
・大会

＜DP2.0以降の適用時＞
■データパックを適用するとエディット内容が取り消され初期状態に戻ります
チーム編成
・代表選出
・移籍

■エディットしていない項目にのみアップデートが適用され、エディットした項目は保持されます
・選手
・チーム
・スタジアム
・大会

　via:http://www.konami.jp/we/2016/online/faq/item.php5?id=97&title=2016&platform=ps3&region=jp&lang=ja